Pittore fiammingo, nato a Anversa nel 1540, dopo essersi formato in patria si trasferì a Bologna dove visse per molti anni. A Bologna fu allievo di Lorenzo Sabbatini con il quale collaborò a Roma tra il 1572 e il 1574 per le decorazioni della Sala Regia in Vaticano. Tornato a Bologna aprì la sua scuola che ebbe come allievi Guido Reni, Francesco Albani e il Domenichino.
Fra le sue opere più importanti sono l'Arcangelo Michele (Bologna, San Petronio) e la Flagellazione nella Pinacoteca Nazionale di Bologna.
Denijs Calvaert morì a Bologna il 16 aprile 1619.