Figlio dell'imperatore Massimiliano II e di Maria di Spagna, nacque a Wiener Neustadt (Austria) nel 1559.
Arciduca d'Austria, cardinale arcivescovo di Toledo, inquisitore generale.
Nel 1599 rinunciò alla porpora e sciolto dai voti sposò Isabella Clara figlia di Filippo II che gli portò in dote i Paesi Bassi.
Combattè con Maurizio di Nassau per conquistare l'Olanda e finì per riconoscere l'indipendenza delle Province Unite.
Morì a Bruxelles il 3 luglio 1621