Pierre d'Aubusson nacque in Francia, a Monteil-au-Vicomte, nel 1423.
Fu capitano di ventura con l'imperatore Sigismondo e con Carlo VII di Francia, quindi entrò nell'Ordine di San Giovanni di Gerusalemme del quale divenne gran maestro nel 1476.
Organizzò le difese dell'isola di Rodi contro la prevista aggressione dei Turchi che in effetti attaccarono il 23 maggio 1480 ma si ritirarono dopo circa due mesi d'assedio.
Dopo questa vittoria Pierre d'Aubusson catturò Djem, fratello del sultano Bajazet e suo competitore nella successione al sultanato dopo la morte del padre Maometto II. In cambio di un cospicuo compenso in denaro Pierre d'Aubusson si impegnò con Bajazet a tenere fuori dalla contesa di successione Djem che rimase prigioniero a Rodi per sei anni. Nel 1489 il detenuto fu ceduto al papa Innocenzo VIII che lo fece tradurre a Roma con l'obiettivo di impedire a Bajazet di minacciare gli stati cattolici, il sultano infatti sapeva che il prestigio del fratello avrebbe potuto minacciare la sua posizione.
Pierre d'Aubusson venne ricompensato dal pontefice con la porpora cardinalizia.
Nei suoi ultimi anni tentò senza successo di organizzare una nuova crociata. Morì a Rodi il 5 luglio 1503.