Figlia di Ferdinando I d'Aragona e di Eleonora d'Albuquerque, nacque nel 1396.
Il padre divenne re d'Aragona nel 1412 (Compromesso di Caspe) e trasferendosi in Aragona lasciò in Castiglia Maria ed i suoi tre fratelli Alfonso, Giovanni e Enrico che furono detti Infanti d'Aragona. Maria venne promessa al cugino Giovanni II, molto più giovane di lei, figlio di Enrico III l'Infermo, che aveva ereditato la corona di Castiglia e Leon sotto la reggenza della madre Caterina di Lancaster.
Gli Infanti d'Aragona divennero consiglieri di Caterina e presto entrarono in contrasto con la nobiltà castigliana capeggiata da Alvaro de Luna.
Il matrimonio fra Giovanni II e Maria fu celebrato il 4 agosto 1419. Maria fu regina di Castiglia e Leon fino alla morte avvenuta il 18 febbraio 1445, durante il suo regno partecipò spesso alle lotte politiche schierandosi con i fratelli contro Alvaro de Luna e a volte anche contro il marito.
Maria e Giovanni ebbero quattro figli: Caterina, Eleonora, Enrico e Maria. Enrico divenne re nel 1454 con il nome di Enrico IV.
Nel 1447 Giovanni II si risposò con Isabella di Portogallo.