Figlio di Andronico II e di Anna d'Ungheria, nacque a Costantinopoli il 17 aprile 1277.
Nel 1294 fu associato all'impero con la direzione delle finanze e della difesa. Riorganizzò le finanze con una nuova imposta e tagli ai donativi e alle spese di corte; combattè contro gli Ottomani che avevano occupato l'Asia Minore e contro la compagnia catalana di Ruggero de Flor che, assoldata da Andronico II contro i Turchi, era passata al nemico.
Michele IX fece uccidere ad Adrianopoli Ruggero de Flor e tutti i Catalani presenti. Combattè ancora contro i Turchi nel 1301, contro i Catalani nel 1305 e di nuovo contro i Turchi nel 1310.
Condivise il potere con il figlio Andronico III ma quando questi fece uccidere per errore il fratello minore Manuele, Michele morì di crepacuore a Tessalonica il 12 ottobre 1320.

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Vedi anche:

Cronologia degli Imperatori di Bisanzio

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