I Borgia (Borja in spagnolo) erano originari di Valencia in Spagna. Alcuni autori ritengono che discendessero da Ramiro I re di Aragona nell'XI secolo.
In genere viene considerato capostipite un Giovanni Borgia, che alcune fonti chiamano Domenico, padre di Alfonso che fu papa con il nome di Callisto III.
Gli esponenti più noti della famiglia durante il Rinascimento italiano furono:

Alfonso Borgia, papa Callisto III

Rodrigo Borgia, papa Alessandro VI

Cesare Borgia detto il Valentino, figlio di Rodrigo

Lucrezia Borgia, figlia di Rodrigo.

Nel XVIII secolo visse Stefano Borgia, erudito e cardinale.